Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCTD3Q9Y597 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD3Q9Y597 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms