Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSDMCQ9BYG8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms