Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNHG12Q9BXW3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms