Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms