Protein–RNA interactions for Protein: Q96JE7

SEC16B, Protein transport protein Sec16B, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16BQ96JE7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms