Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DTX3LQ8TDB6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms