Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUF8

RIOX2, Ribosomal oxygenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOX2Q8IUF8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIOX2Q8IUF8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RIOX2Q8IUF8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIOX2Q8IUF8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIOX2Q8IUF8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIOX2Q8IUF8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIOX2Q8IUF8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RIOX2Q8IUF8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIOX2Q8IUF8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIOX2Q8IUF8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIOX2Q8IUF8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIOX2Q8IUF8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIOX2Q8IUF8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIOX2Q8IUF8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIOX2Q8IUF8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIOX2Q8IUF8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIOX2Q8IUF8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIOX2Q8IUF8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIOX2Q8IUF8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RIOX2Q8IUF8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIOX2Q8IUF8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIOX2Q8IUF8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIOX2Q8IUF8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms