Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
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COL24A1Q17RW2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
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COL24A1Q17RW2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
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COL24A1Q17RW2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
COL24A1Q17RW2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
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COL24A1Q17RW2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
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