Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ME3Q16798 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ME3Q16798 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ME3Q16798 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ME3Q16798 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ME3Q16798 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ME3Q16798 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ME3Q16798 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ME3Q16798 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ME3Q16798 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ME3Q16798 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ME3Q16798 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ME3Q16798 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ME3Q16798 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ME3Q16798 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ME3Q16798 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ME3Q16798 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ME3Q16798 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ME3Q16798 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ME3Q16798 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ME3Q16798 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ME3Q16798 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ME3Q16798 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ME3Q16798 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ME3Q16798 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ME3Q16798 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ME3Q16798 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ME3Q16798 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ME3Q16798 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ME3Q16798 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ME3Q16798 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ME3Q16798 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ME3Q16798 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ME3Q16798 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ME3Q16798 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ME3Q16798 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ME3Q16798 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ME3Q16798 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ME3Q16798 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ME3Q16798 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ME3Q16798 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ME3Q16798 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ME3Q16798 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ME3Q16798 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ME3Q16798 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ME3Q16798 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ME3Q16798 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ME3Q16798 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
ME3Q16798 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ME3Q16798 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ME3Q16798 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ME3Q16798 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ME3Q16798 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ME3Q16798 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ME3Q16798 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ME3Q16798 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ME3Q16798 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ME3Q16798 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ME3Q16798 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ME3Q16798 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ME3Q16798 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ME3Q16798 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ME3Q16798 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ME3Q16798 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ME3Q16798 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ME3Q16798 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ME3Q16798 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ME3Q16798 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ME3Q16798 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ME3Q16798 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ME3Q16798 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ME3Q16798 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ME3Q16798 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ME3Q16798 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ME3Q16798 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ME3Q16798 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ME3Q16798 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ME3Q16798 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ME3Q16798 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ME3Q16798 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ME3Q16798 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ME3Q16798 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ME3Q16798 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ME3Q16798 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ME3Q16798 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ME3Q16798 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ME3Q16798 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ME3Q16798 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ME3Q16798 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ME3Q16798 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ME3Q16798 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ME3Q16798 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ME3Q16798 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ME3Q16798 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ME3Q16798 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ME3Q16798 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ME3Q16798 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ME3Q16798 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ME3Q16798 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ME3Q16798 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
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