Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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