Protein–RNA interactions for Protein: Q15053

KIAA0040, Uncharacterized protein KIAA0040, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0040Q15053 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KIAA0040Q15053 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KIAA0040Q15053 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KIAA0040Q15053 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KIAA0040Q15053 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KIAA0040Q15053 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIAA0040Q15053 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIAA0040Q15053 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIAA0040Q15053 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIAA0040Q15053 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KIAA0040Q15053 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIAA0040Q15053 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIAA0040Q15053 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIAA0040Q15053 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIAA0040Q15053 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIAA0040Q15053 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIAA0040Q15053 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIAA0040Q15053 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIAA0040Q15053 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIAA0040Q15053 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KIAA0040Q15053 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIAA0040Q15053 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIAA0040Q15053 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIAA0040Q15053 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIAA0040Q15053 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIAA0040Q15053 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KIAA0040Q15053 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KIAA0040Q15053 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KIAA0040Q15053 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KIAA0040Q15053 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KIAA0040Q15053 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KIAA0040Q15053 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KIAA0040Q15053 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms