Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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