Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALCOCO2Q13137 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CALCOCO2Q13137 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
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