Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHKA1P46020 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms