Protein–RNA interactions for Protein: P41250

GARS, Glycine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARSP41250 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GARSP41250 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GARSP41250 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GARSP41250 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GARSP41250 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GARSP41250 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GARSP41250 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GARSP41250 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GARSP41250 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GARSP41250 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GARSP41250 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GARSP41250 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GARSP41250 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GARSP41250 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GARSP41250 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GARSP41250 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GARSP41250 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GARSP41250 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GARSP41250 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GARSP41250 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GARSP41250 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GARSP41250 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GARSP41250 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GARSP41250 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GARSP41250 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GARSP41250 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GARSP41250 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GARSP41250 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GARSP41250 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GARSP41250 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GARSP41250 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GARSP41250 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GARSP41250 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GARSP41250 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GARSP41250 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GARSP41250 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GARSP41250 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GARSP41250 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GARSP41250 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GARSP41250 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GARSP41250 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GARSP41250 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GARSP41250 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GARSP41250 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GARSP41250 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GARSP41250 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GARSP41250 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GARSP41250 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GARSP41250 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GARSP41250 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GARSP41250 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GARSP41250 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GARSP41250 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GARSP41250 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GARSP41250 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GARSP41250 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GARSP41250 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GARSP41250 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GARSP41250 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GARSP41250 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GARSP41250 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GARSP41250 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GARSP41250 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GARSP41250 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GARSP41250 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GARSP41250 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GARSP41250 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GARSP41250 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GARSP41250 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GARSP41250 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GARSP41250 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GARSP41250 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GARSP41250 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GARSP41250 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GARSP41250 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GARSP41250 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GARSP41250 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GARSP41250 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GARSP41250 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GARSP41250 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GARSP41250 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GARSP41250 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GARSP41250 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GARSP41250 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GARSP41250 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GARSP41250 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GARSP41250 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GARSP41250 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GARSP41250 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GARSP41250 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GARSP41250 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GARSP41250 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GARSP41250 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GARSP41250 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GARSP41250 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GARSP41250 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GARSP41250 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GARSP41250 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GARSP41250 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GARSP41250 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms