Protein–RNA interactions for Protein: P23508

MCC, Colorectal mutant cancer protein, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCP23508 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCCP23508 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCCP23508 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCCP23508 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCCP23508 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCCP23508 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCCP23508 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCCP23508 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCCP23508 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCCP23508 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCCP23508 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCCP23508 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCCP23508 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MCCP23508 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCCP23508 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCCP23508 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCCP23508 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCCP23508 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MCCP23508 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCCP23508 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCCP23508 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCCP23508 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCCP23508 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCCP23508 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCCP23508 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCCP23508 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCCP23508 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCCP23508 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCCP23508 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCCP23508 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCCP23508 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCCP23508 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCCP23508 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCCP23508 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCCP23508 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCCP23508 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCCP23508 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCCP23508 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCCP23508 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MCCP23508 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCCP23508 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCCP23508 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCCP23508 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCCP23508 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MCCP23508 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MCCP23508 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MCCP23508 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCCP23508 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MCCP23508 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCCP23508 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCCP23508 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCCP23508 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCCP23508 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCCP23508 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCCP23508 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCCP23508 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCCP23508 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCCP23508 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCCP23508 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCCP23508 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCCP23508 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MCCP23508 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCCP23508 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCCP23508 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCCP23508 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCCP23508 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCCP23508 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCCP23508 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCCP23508 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MCCP23508 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCCP23508 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCCP23508 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCCP23508 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MCCP23508 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MCCP23508 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCCP23508 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCCP23508 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCCP23508 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCCP23508 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCCP23508 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCCP23508 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCCP23508 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCCP23508 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCCP23508 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCCP23508 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCCP23508 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCCP23508 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCCP23508 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCCP23508 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MCCP23508 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCCP23508 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCCP23508 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCCP23508 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCCP23508 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCCP23508 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCCP23508 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCCP23508 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCCP23508 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCCP23508 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MCCP23508 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms