Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAF1P21675 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAF1P21675 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAF1P21675 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAF1P21675 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAF1P21675 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAF1P21675 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAF1P21675 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAF1P21675 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAF1P21675 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF1P21675 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF1P21675 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF1P21675 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF1P21675 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF1P21675 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF1P21675 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF1P21675 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF1P21675 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF1P21675 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF1P21675 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF1P21675 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF1P21675 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF1P21675 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF1P21675 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF1P21675 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF1P21675 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TAF1P21675 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TAF1P21675 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TAF1P21675 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TAF1P21675 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TAF1P21675 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TAF1P21675 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TAF1P21675 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF1P21675 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF1P21675 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF1P21675 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF1P21675 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF1P21675 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF1P21675 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF1P21675 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF1P21675 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF1P21675 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF1P21675 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF1P21675 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF1P21675 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF1P21675 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF1P21675 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF1P21675 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF1P21675 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF1P21675 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF1P21675 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF1P21675 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF1P21675 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF1P21675 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF1P21675 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF1P21675 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF1P21675 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF1P21675 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF1P21675 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF1P21675 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF1P21675 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF1P21675 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF1P21675 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF1P21675 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF1P21675 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF1P21675 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF1P21675 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF1P21675 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF1P21675 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF1P21675 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF1P21675 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF1P21675 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF1P21675 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF1P21675 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF1P21675 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF1P21675 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF1P21675 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF1P21675 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF1P21675 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF1P21675 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF1P21675 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF1P21675 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF1P21675 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF1P21675 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF1P21675 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF1P21675 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TAF1P21675 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF1P21675 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF1P21675 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF1P21675 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF1P21675 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF1P21675 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF1P21675 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF1P21675 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF1P21675 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF1P21675 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF1P21675 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF1P21675 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF1P21675 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF1P21675 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms