Protein–RNA interactions for Protein: P0CI26

TRIM49C, Tripartite motif-containing protein 49C, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49CP0CI26 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM49CP0CI26 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM49CP0CI26 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms