Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEFLP07196 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NEFLP07196 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEFLP07196 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEFLP07196 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEFLP07196 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEFLP07196 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEFLP07196 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEFLP07196 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEFLP07196 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEFLP07196 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEFLP07196 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEFLP07196 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEFLP07196 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEFLP07196 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEFLP07196 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEFLP07196 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEFLP07196 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEFLP07196 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEFLP07196 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEFLP07196 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEFLP07196 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEFLP07196 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEFLP07196 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEFLP07196 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEFLP07196 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEFLP07196 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEFLP07196 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEFLP07196 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEFLP07196 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEFLP07196 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEFLP07196 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEFLP07196 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEFLP07196 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NEFLP07196 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEFLP07196 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEFLP07196 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEFLP07196 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEFLP07196 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEFLP07196 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NEFLP07196 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEFLP07196 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEFLP07196 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEFLP07196 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEFLP07196 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEFLP07196 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEFLP07196 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEFLP07196 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEFLP07196 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEFLP07196 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEFLP07196 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEFLP07196 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEFLP07196 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEFLP07196 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEFLP07196 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEFLP07196 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEFLP07196 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEFLP07196 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEFLP07196 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEFLP07196 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEFLP07196 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEFLP07196 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEFLP07196 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEFLP07196 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NEFLP07196 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEFLP07196 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEFLP07196 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NEFLP07196 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEFLP07196 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEFLP07196 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEFLP07196 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEFLP07196 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEFLP07196 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEFLP07196 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEFLP07196 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEFLP07196 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEFLP07196 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEFLP07196 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEFLP07196 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEFLP07196 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEFLP07196 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEFLP07196 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEFLP07196 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEFLP07196 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEFLP07196 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEFLP07196 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEFLP07196 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEFLP07196 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NEFLP07196 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NEFLP07196 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEFLP07196 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEFLP07196 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEFLP07196 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEFLP07196 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEFLP07196 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEFLP07196 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEFLP07196 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEFLP07196 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEFLP07196 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEFLP07196 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms