Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCP110O43303 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCP110O43303 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCP110O43303 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCP110O43303 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCP110O43303 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCP110O43303 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCP110O43303 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCP110O43303 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCP110O43303 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCP110O43303 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCP110O43303 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCP110O43303 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCP110O43303 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCP110O43303 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCP110O43303 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCP110O43303 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCP110O43303 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCP110O43303 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCP110O43303 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCP110O43303 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCP110O43303 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCP110O43303 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCP110O43303 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCP110O43303 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCP110O43303 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCP110O43303 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCP110O43303 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCP110O43303 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCP110O43303 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCP110O43303 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCP110O43303 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCP110O43303 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCP110O43303 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCP110O43303 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCP110O43303 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCP110O43303 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCP110O43303 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCP110O43303 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCP110O43303 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCP110O43303 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCP110O43303 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCP110O43303 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCP110O43303 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCP110O43303 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCP110O43303 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCP110O43303 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCP110O43303 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCP110O43303 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCP110O43303 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCP110O43303 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCP110O43303 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCP110O43303 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCP110O43303 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCP110O43303 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCP110O43303 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCP110O43303 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCP110O43303 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCP110O43303 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCP110O43303 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCP110O43303 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCP110O43303 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCP110O43303 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCP110O43303 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCP110O43303 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCP110O43303 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCP110O43303 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCP110O43303 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCP110O43303 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCP110O43303 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCP110O43303 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCP110O43303 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCP110O43303 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCP110O43303 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCP110O43303 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCP110O43303 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCP110O43303 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCP110O43303 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCP110O43303 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCP110O43303 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCP110O43303 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCP110O43303 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCP110O43303 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCP110O43303 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCP110O43303 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCP110O43303 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCP110O43303 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCP110O43303 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCP110O43303 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCP110O43303 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCP110O43303 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCP110O43303 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCP110O43303 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCP110O43303 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCP110O43303 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCP110O43303 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCP110O43303 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCP110O43303 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCP110O43303 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCP110O43303 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms