Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCDHB6Q9Y5E3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms