Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NOP58Q9Y2X3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms