Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms