Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC3Q9BY71 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms