Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ1

C1QTNF1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF1Q9BXJ1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1QTNF1Q9BXJ1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1QTNF1Q9BXJ1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1QTNF1Q9BXJ1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1QTNF1Q9BXJ1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1QTNF1Q9BXJ1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
C1QTNF1Q9BXJ1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1QTNF1Q9BXJ1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1QTNF1Q9BXJ1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1QTNF1Q9BXJ1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1QTNF1Q9BXJ1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1QTNF1Q9BXJ1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
C1QTNF1Q9BXJ1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1QTNF1Q9BXJ1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1QTNF1Q9BXJ1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1QTNF1Q9BXJ1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1QTNF1Q9BXJ1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1QTNF1Q9BXJ1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C1QTNF1Q9BXJ1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1QTNF1Q9BXJ1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1QTNF1Q9BXJ1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C1QTNF1Q9BXJ1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1QTNF1Q9BXJ1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1QTNF1Q9BXJ1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1QTNF1Q9BXJ1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1QTNF1Q9BXJ1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1QTNF1Q9BXJ1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1QTNF1Q9BXJ1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1QTNF1Q9BXJ1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms