Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERGIC2Q96RQ1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms