Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX27Q96GQ7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms