Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC37.82■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC37.8■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC37.77■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
TOPBP1Q92547 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms