Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CKAP2LQ8IYA6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CKAP2LQ8IYA6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms