Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CASC2Q6XLA1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234.2 ms