Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S1

DENND1B, DENN domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND1BQ6P3S1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND1BQ6P3S1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND1BQ6P3S1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND1BQ6P3S1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND1BQ6P3S1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND1BQ6P3S1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND1BQ6P3S1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND1BQ6P3S1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND1BQ6P3S1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND1BQ6P3S1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND1BQ6P3S1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND1BQ6P3S1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND1BQ6P3S1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND1BQ6P3S1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND1BQ6P3S1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND1BQ6P3S1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND1BQ6P3S1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND1BQ6P3S1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND1BQ6P3S1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND1BQ6P3S1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND1BQ6P3S1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND1BQ6P3S1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DENND1BQ6P3S1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DENND1BQ6P3S1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DENND1BQ6P3S1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DENND1BQ6P3S1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DENND1BQ6P3S1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DENND1BQ6P3S1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DENND1BQ6P3S1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DENND1BQ6P3S1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DENND1BQ6P3S1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DENND1BQ6P3S1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DENND1BQ6P3S1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DENND1BQ6P3S1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DENND1BQ6P3S1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DENND1BQ6P3S1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DENND1BQ6P3S1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms