Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF4Q2M2E3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms