Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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EXT1Q16394 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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EXT1Q16394 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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EXT1Q16394 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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EXT1Q16394 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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EXT1Q16394 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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EXT1Q16394 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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EXT1Q16394 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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EXT1Q16394 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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EXT1Q16394 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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EXT1Q16394 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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EXT1Q16394 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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EXT1Q16394 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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EXT1Q16394 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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EXT1Q16394 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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EXT1Q16394 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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EXT1Q16394 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXT1Q16394 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXT1Q16394 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXT1Q16394 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXT1Q16394 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXT1Q16394 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXT1Q16394 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXT1Q16394 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXT1Q16394 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXT1Q16394 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXT1Q16394 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EXT1Q16394 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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