Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFTN1Q14699 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFTN1Q14699 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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