Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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