Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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