Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC36.42■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC36.39■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.42
GRIN2AQ12879 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 323.3 ms