Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFIAQ12857 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
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