Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
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