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Protein–RNA interactions for Protein: Q03691
ROT1, Protein ROT1, yeast
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256 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
ROT1
Q03691
RLP24
YLR009W
600 nt
5.2
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
YLR317W
YLR317W
435 nt
5.2
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
YLR406C-A
YLR406C-A
150 nt
5.2
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
YNR061C
YNR061C
660 nt
5.2
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
CYC2
YOR037W
1101 nt
5.2
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
PET123
YOR158W
957 nt
5.2
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
GRE1
YPL223C
507 nt
5.2
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
NUP1
YOR098C
3231 nt
5.2
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
ENT2
YLR206W
1842 nt
5.2
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
GPT2
YKR067W
2232 nt
5.2
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
MMP1
YLL061W
1752 nt
5.19
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
YJR015W
YJR015W
1533 nt
5.19
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
URK1
YNR012W
1506 nt
5.19
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
DED81
YHR019C
1665 nt
5.19
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
YDR203W
YDR203W
318 nt
5.19
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
LRS4
YDR439W
1044 nt
5.19
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
ARP1
YHR129C
1155 nt
5.19
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
GAT4
YIR013C
366 nt
5.19
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
LDB18
YLL049W
540 nt
5.19
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
SSK1
YLR006C
2139 nt
5.19
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
YHC1
YLR298C
696 nt
5.19
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
YMR158C-A
YMR158C-A
138 nt
5.19
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
TRI1
YMR233W
681 nt
5.19
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
MRPL17
YNL252C
846 nt
5.19
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
RCL1
YOL010W
1104 nt
5.19
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
AIM39
YOL053W
1188 nt
5.19
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
PIF1
YML061C
2580 nt
5.19
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
HXT15
YDL245C
1704 nt
5.19
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
PHO8
YDR481C
1701 nt
5.19
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
HXT16
YJR158W
1704 nt
5.19
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
KEL1
YHR158C
3495 nt
5.19
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
TAX4
YJL083W
1815 nt
5.18
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
RTR1
YER139C
681 nt
5.18
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
TYS1
YGR185C
1185 nt
5.18
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
SFC1
YJR095W
969 nt
5.18
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
ERG3
YLR056W
1098 nt
5.18
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
YNL277W-A
YNL277W-A
189 nt
5.18
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
IZH2
YOL002C
954 nt
5.18
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
TMA16
YOR252W
537 nt
5.18
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
RRG8
YPR116W
834 nt
5.18
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
IBA57
YJR122W
1494 nt
5.18
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
POP1
YNL221C
2628 nt
5.17
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
PPR1
YLR014C
2715 nt
5.17
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
MMF1
YIL051C
438 nt
5.17
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
PRM10
YJL108C
1152 nt
5.17
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
YAL069W
YAL069W
315 nt
5.17
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
MAP1
YLR244C
1164 nt
5.17
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
SAM4
YPL273W
978 nt
5.17
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
CLB2
YPR119W
1476 nt
5.17
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
YDR210W-A
YDR210W-A
1317 nt
5.17
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
NOP58
YOR310C
1536 nt
5.17
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
EAR1
YMR171C
1653 nt
5.16
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
CSC1
YLR241W
2349 nt
5.16
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
VCX1
YDL128W
1236 nt
5.16
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
RPL24A
YGL031C
468 nt
5.16
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
TYW3
YGL050W
822 nt
5.16
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
TAD1
YGL243W
1203 nt
5.16
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
SEC17
YBL050W
879 nt
5.16
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
SPC29
YPL124W
762 nt
5.16
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
YPL205C
YPL205C
345 nt
5.16
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
FDH2
YPL275W
711 nt
5.16
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
VPS38
YLR360W
1320 nt
5.16
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
YHR202W
YHR202W
1809 nt
5.16
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
TYR1
YBR166C
1359 nt
5.16
□□□□□ -1.58
ROT1
Q03691
YER084W-A
YER084W-A
513 nt
5.15
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
YGL204C
YGL204C
306 nt
5.15
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
OST5
YGL226C-A
261 nt
5.15
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
PUS6
YGR169C
1215 nt
5.15
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
YIL028W
YIL028W
399 nt
5.15
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
RPS0B
YLR048W
759 nt
5.15
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
SHE1
YBL031W
1017 nt
5.15
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
ARF3
YOR094W
552 nt
5.15
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
YPL062W
YPL062W
405 nt
5.15
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
SSO1
YPL232W
873 nt
5.15
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
SDA1
YGR245C
2304 nt
5.15
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
ZRC1
YMR243C
1329 nt
5.15
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
TRM13
YOL125W
1431 nt
5.14
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
THI22
YPR121W
1719 nt
5.14
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
ALT2
YDR111C
1524 nt
5.14
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
RPL13A
YDL082W
600 nt
5.14
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
YER133W-A
YER133W-A
342 nt
5.14
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
YGL159W
YGL159W
1113 nt
5.14
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
SCM4
YGR049W
564 nt
5.14
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
YGR127W
YGR127W
939 nt
5.14
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
SCW4
YGR279C
1161 nt
5.14
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
YGR293C
YGR293C
462 nt
5.14
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
YJL007C
YJL007C
315 nt
5.14
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
YJR141W
YJR141W
1044 nt
5.14
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
YKL115C
YKL115C
393 nt
5.14
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
SDH3
YKL141W
597 nt
5.14
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
CDC123
YLR215C
1083 nt
5.14
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
MIX23
YBL107C
591 nt
5.14
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
ERI1
YPL096C-A
207 nt
5.14
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
MRP51
YPL118W
1035 nt
5.14
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
PEP4
YPL154C
1218 nt
5.14
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
YBR300C
YBR300C
498 nt
5.14
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
FBP26
YJL155C
1359 nt
5.14
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
IMA3
YIL172C
1770 nt
5.14
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
IMA4
YJL221C
1770 nt
5.14
□□□□□ -1.59
ROT1
Q03691
AVT2
YEL064C
1443 nt
5.14
□□□□□ -1.59
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