Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms