Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms