Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPB1P53618 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPB1P53618 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPB1P53618 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPB1P53618 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPB1P53618 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPB1P53618 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COPB1P53618 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPB1P53618 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPB1P53618 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPB1P53618 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPB1P53618 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPB1P53618 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPB1P53618 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPB1P53618 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPB1P53618 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COPB1P53618 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPB1P53618 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COPB1P53618 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPB1P53618 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPB1P53618 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPB1P53618 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPB1P53618 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPB1P53618 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPB1P53618 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPB1P53618 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPB1P53618 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPB1P53618 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COPB1P53618 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPB1P53618 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPB1P53618 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPB1P53618 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPB1P53618 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPB1P53618 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPB1P53618 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPB1P53618 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPB1P53618 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPB1P53618 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPB1P53618 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPB1P53618 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPB1P53618 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COPB1P53618 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPB1P53618 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPB1P53618 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPB1P53618 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPB1P53618 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPB1P53618 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPB1P53618 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPB1P53618 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPB1P53618 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPB1P53618 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPB1P53618 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPB1P53618 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPB1P53618 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPB1P53618 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPB1P53618 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPB1P53618 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPB1P53618 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COPB1P53618 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPB1P53618 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPB1P53618 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPB1P53618 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPB1P53618 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPB1P53618 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPB1P53618 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COPB1P53618 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPB1P53618 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPB1P53618 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPB1P53618 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPB1P53618 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPB1P53618 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPB1P53618 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPB1P53618 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPB1P53618 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPB1P53618 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPB1P53618 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPB1P53618 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPB1P53618 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPB1P53618 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPB1P53618 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPB1P53618 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPB1P53618 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPB1P53618 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPB1P53618 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPB1P53618 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPB1P53618 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPB1P53618 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPB1P53618 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COPB1P53618 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
COPB1P53618 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COPB1P53618 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COPB1P53618 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPB1P53618 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPB1P53618 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPB1P53618 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPB1P53618 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPB1P53618 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPB1P53618 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPB1P53618 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPB1P53618 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms