Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGA1P17096 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms