Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB1P08034 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB1P08034 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB1P08034 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB1P08034 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB1P08034 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB1P08034 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB1P08034 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB1P08034 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB1P08034 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB1P08034 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB1P08034 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB1P08034 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB1P08034 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB1P08034 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB1P08034 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB1P08034 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB1P08034 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB1P08034 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB1P08034 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB1P08034 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB1P08034 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB1P08034 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB1P08034 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB1P08034 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB1P08034 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB1P08034 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB1P08034 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB1P08034 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB1P08034 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB1P08034 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB1P08034 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB1P08034 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB1P08034 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB1P08034 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB1P08034 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB1P08034 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB1P08034 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB1P08034 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB1P08034 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB1P08034 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB1P08034 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB1P08034 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB1P08034 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB1P08034 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB1P08034 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB1P08034 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB1P08034 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB1P08034 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB1P08034 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB1P08034 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB1P08034 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB1P08034 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB1P08034 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB1P08034 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB1P08034 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB1P08034 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB1P08034 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB1P08034 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB1P08034 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB1P08034 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJB1P08034 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJB1P08034 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GJB1P08034 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJB1P08034 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GJB1P08034 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJB1P08034 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJB1P08034 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJB1P08034 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJB1P08034 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
GJB1P08034 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GJB1P08034 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB1P08034 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB1P08034 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB1P08034 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB1P08034 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB1P08034 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB1P08034 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB1P08034 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB1P08034 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB1P08034 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB1P08034 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB1P08034 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB1P08034 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB1P08034 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB1P08034 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB1P08034 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB1P08034 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB1P08034 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB1P08034 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB1P08034 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB1P08034 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB1P08034 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB1P08034 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB1P08034 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB1P08034 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB1P08034 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB1P08034 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB1P08034 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB1P08034 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms