Protein–RNA interactions for Protein: P02381

VAR1, Ribosomal protein VAR1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 398 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	P02381	YNR042W	YNR042W	429 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	GLO4	YOR040W	858 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	FKH1	YIL131C	1455 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	SRP72	YPL210C	1923 nt		3.13	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	KAP95	YLR347C	2586 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	ZDS2	YML109W	2829 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	ATG21	YPL100W	1491 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	ELO2	YCR034W	1044 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	YCR075W-A	YCR075W-A	228 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	YDR464C-A	YDR464C-A	189 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	ACP1	YKL192C	378 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	YMR010W	YMR010W	1218 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	YBL059W	YBL059W	582 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	YNG1	YOR064C	660 nt		3.12	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	SEA4	YBL104C	3117 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	BYE1	YKL005C	1785 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	SEO1	YAL067C	1782 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	YNK1	YKL067W	462 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	MRP8	YKL142W	660 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	YLR364C-A	YLR364C-A	123 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	NIS1	YNL078W	1224 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	RPL18B	YNL301C	561 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	RPL18A	YOL120C	561 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	FDH2	YPL275W	711 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	snR3	snR3	194 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	EFM2	YBR271W	1260 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	SUC2	YIL162W	1599 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	BUD27	YFL023W	2391 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	NSP1	YJL041W	2472 nt		3.11	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	LYP1	YNL268W	1836 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	YNR065C	YNR065C	3351 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	YLR177W	YLR177W	1887 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	NBP2	YDR162C	711 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	API2	YDR525W	330 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	VFA1	YER128W	612 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	YHR112C	YHR112C	1137 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	YIL163C	YIL163C	354 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	YIR017W-A	YIR017W-A	600 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	YJR096W	YJR096W	849 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	YLR122C	YLR122C	378 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	REH1	YLR387C	1299 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	HEM15	YOR176W	1182 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	RRP36	YOR287C	903 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	CHL1	YPL008W	2586 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	STU1	YBL034C	4542 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	GDH2	YDL215C	3279 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	FOX2	YKR009C	2703 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	MSK1	YNL073W	1731 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	TFA1	YKL028W	1449 nt		3.1	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	SYT1	YPR095C	3681 nt		3.09	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	RXT3	YDL076C	885 nt		3.09	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	YKT6	YKL196C	603 nt		3.09	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	SPT6	YGR116W	4356 nt		3.09	□□□□□ -1.91
VAR1	P02381	AVT7	YIL088C	1473 nt		3.09	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	ADY3	YDL239C	2373 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	DAS2	YDR020C	699 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	SPC19	YDR201W	498 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	RPB3	YIL021W	957 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	AIR1	YIL079C	1083 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	YAE1	YJR067C	426 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	PNG1	YPL096W	1092 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	DSS4	YPR017C	432 nt		3.08	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	UPS3	YDR185C	540 nt		3.07	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	YFR045W	YFR045W	930 nt		3.07	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	tX(XXX)D	tX(XXX)D	100 nt		3.07	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	YAR023C	YAR023C	540 nt		3.07	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	IBD2	YNL164C	1056 nt		3.07	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	YAR1	YPL239W	603 nt		3.07	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	PWP2	YCR057C	2772 nt		3.07	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	ACE2	YLR131C	2313 nt		3.07	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	SPT4	YGR063C	309 nt		3.06	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	YHR214C-E	YHR214C-E	300 nt		3.06	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	RSC58	YLR033W	1509 nt		3.06	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	YAR070C	YAR070C	300 nt		3.06	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	ATG23	YLR431C	1362 nt		3.06	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	GTR1	YML121W	933 nt		3.06	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	MAC1	YMR021C	1254 nt		3.06	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	MRE11	YMR224C	2079 nt		3.06	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	CNM67	YNL225C	1746 nt		3.06	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	MNT4	YNR059W	1743 nt		3.06	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	GDT1	YBR187W	843 nt		3.06	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	POL1	YNL102W	4407 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	ELM1	YKL048C	1923 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	LOS1	YKL205W	3303 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	DIT2	YDR402C	1470 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	RPN2	YIL075C	2838 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	RNR1	YER070W	2667 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	FLO9	YAL063C	3969 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	NPL6	YMR091C	1308 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	STE14	YDR410C	720 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	KRE28	YDR532C	1158 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	BUD25	YER014C-A	462 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	SOP4	YJL192C	705 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	SOD1	YJR104C	465 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	CBT1	YKL208W	816 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	YMR114C	YMR114C	1107 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	SWP1	YMR149W	861 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	TOM40	YMR203W	1164 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	YOR292C	YOR292C	930 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	YBR056W-A	YBR056W-A	201 nt		3.05	□□□□□ -1.92

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