Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms