Protein–RNA interactions for Protein: O60658

PDE8A, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8A, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8AO60658 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE8AO60658 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PDE8AO60658 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PDE8AO60658 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PDE8AO60658 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PDE8AO60658 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE8AO60658 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE8AO60658 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PDE8AO60658 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE8AO60658 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE8AO60658 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PDE8AO60658 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PDE8AO60658 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PDE8AO60658 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PDE8AO60658 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE8AO60658 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PDE8AO60658 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
PDE8AO60658 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PDE8AO60658 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE8AO60658 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
PDE8AO60658 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PDE8AO60658 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PDE8AO60658 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE8AO60658 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE8AO60658 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE8AO60658 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE8AO60658 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE8AO60658 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE8AO60658 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PDE8AO60658 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE8AO60658 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE8AO60658 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE8AO60658 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE8AO60658 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE8AO60658 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE8AO60658 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE8AO60658 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PDE8AO60658 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE8AO60658 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PDE8AO60658 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PDE8AO60658 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PDE8AO60658 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE8AO60658 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE8AO60658 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms