Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCSO14618 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCSO14618 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCSO14618 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCSO14618 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCSO14618 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCSO14618 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCSO14618 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCSO14618 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCSO14618 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCSO14618 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCSO14618 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCSO14618 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCSO14618 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCSO14618 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCSO14618 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCSO14618 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCSO14618 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCSO14618 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCSO14618 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCSO14618 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCSO14618 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCSO14618 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCSO14618 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCSO14618 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCSO14618 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCSO14618 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCSO14618 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCSO14618 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCSO14618 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCSO14618 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCSO14618 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCSO14618 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCSO14618 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCSO14618 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCSO14618 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCSO14618 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCSO14618 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCSO14618 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCSO14618 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCSO14618 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCSO14618 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCSO14618 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCSO14618 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCSO14618 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCSO14618 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCSO14618 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCSO14618 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCSO14618 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCSO14618 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCSO14618 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCSO14618 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCSO14618 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCSO14618 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCSO14618 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCSO14618 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCSO14618 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCSO14618 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCSO14618 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCSO14618 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCSO14618 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCSO14618 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCSO14618 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCSO14618 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCSO14618 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCSO14618 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCSO14618 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCSO14618 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCSO14618 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCSO14618 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCSO14618 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCSO14618 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSO14618 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSO14618 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSO14618 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSO14618 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSO14618 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSO14618 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSO14618 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCSO14618 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSO14618 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSO14618 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSO14618 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSO14618 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSO14618 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSO14618 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSO14618 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSO14618 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSO14618 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSO14618 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSO14618 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSO14618 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSO14618 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSO14618 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSO14618 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCSO14618 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCSO14618 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCSO14618 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCSO14618 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCSO14618 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms