Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAD1O00515 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAD1O00515 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAD1O00515 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAD1O00515 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAD1O00515 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LAD1O00515 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAD1O00515 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAD1O00515 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAD1O00515 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAD1O00515 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAD1O00515 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAD1O00515 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAD1O00515 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAD1O00515 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAD1O00515 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAD1O00515 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAD1O00515 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAD1O00515 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAD1O00515 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAD1O00515 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAD1O00515 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAD1O00515 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAD1O00515 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAD1O00515 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAD1O00515 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAD1O00515 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAD1O00515 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAD1O00515 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LAD1O00515 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAD1O00515 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAD1O00515 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAD1O00515 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAD1O00515 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAD1O00515 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LAD1O00515 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAD1O00515 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LAD1O00515 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LAD1O00515 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LAD1O00515 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LAD1O00515 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAD1O00515 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAD1O00515 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAD1O00515 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAD1O00515 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAD1O00515 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LAD1O00515 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LAD1O00515 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAD1O00515 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAD1O00515 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAD1O00515 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAD1O00515 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LAD1O00515 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LAD1O00515 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LAD1O00515 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LAD1O00515 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LAD1O00515 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LAD1O00515 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAD1O00515 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LAD1O00515 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LAD1O00515 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LAD1O00515 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAD1O00515 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAD1O00515 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAD1O00515 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAD1O00515 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAD1O00515 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAD1O00515 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LAD1O00515 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAD1O00515 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAD1O00515 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAD1O00515 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LAD1O00515 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAD1O00515 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAD1O00515 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAD1O00515 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAD1O00515 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAD1O00515 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAD1O00515 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAD1O00515 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAD1O00515 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAD1O00515 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAD1O00515 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LAD1O00515 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAD1O00515 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAD1O00515 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAD1O00515 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAD1O00515 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAD1O00515 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAD1O00515 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAD1O00515 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAD1O00515 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAD1O00515 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAD1O00515 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAD1O00515 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAD1O00515 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAD1O00515 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAD1O00515 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAD1O00515 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAD1O00515 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms